diff --git a/drivers/pci/host/pcie-xilinx.c b/drivers/pci/host/pcie-xilinx.c
index 9a8d5ad1dd70..a7880bed56fc 100644
--- a/drivers/pci/host/pcie-xilinx.c
+++ b/drivers/pci/host/pcie-xilinx.c
@@ -385,7 +385,7 @@ static irqreturn_t xilinx_pcie_intr_handler(int irq, void *data)
 {
 	struct xilinx_pcie_port *port = (struct xilinx_pcie_port *)data;
 	struct device *dev = port->dev;
-	u32 val, mask, status, msi_data;
+	u32 val, mask, status;
 
 	/* Read interrupt decode and mask registers */
 	val = pcie_read(port, XILINX_PCIE_REG_IDR);
@@ -425,8 +425,7 @@ static irqreturn_t xilinx_pcie_intr_handler(int irq, void *data)
 		xilinx_pcie_clear_err_interrupts(port);
 	}
 
-	if (status & XILINX_PCIE_INTR_INTX) {
-		/* INTx interrupt received */
+	if (status & (XILINX_PCIE_INTR_INTX | XILINX_PCIE_INTR_MSI)) {
 		val = pcie_read(port, XILINX_PCIE_REG_RPIFR1);
 
 		/* Check whether interrupt valid */
@@ -435,41 +434,24 @@ static irqreturn_t xilinx_pcie_intr_handler(int irq, void *data)
 			goto error;
 		}
 
-		if (!(val & XILINX_PCIE_RPIFR1_MSI_INTR)) {
-			/* Clear interrupt FIFO register 1 */
-			pcie_write(port, XILINX_PCIE_RPIFR1_ALL_MASK,
-				   XILINX_PCIE_REG_RPIFR1);
-
-			/* Handle INTx Interrupt */
+		/* Decode the IRQ number */
+		if (val & XILINX_PCIE_RPIFR1_MSI_INTR) {
+			val = pcie_read(port, XILINX_PCIE_REG_RPIFR2) &
+				XILINX_PCIE_RPIFR2_MSG_DATA;
+		} else {
 			val = (val & XILINX_PCIE_RPIFR1_INTR_MASK) >>
 				XILINX_PCIE_RPIFR1_INTR_SHIFT;
-			generic_handle_irq(irq_find_mapping(port->leg_domain,
-							    val));
-		}
-	}
-
-	if (status & XILINX_PCIE_INTR_MSI) {
-		/* MSI Interrupt */
-		val = pcie_read(port, XILINX_PCIE_REG_RPIFR1);
-
-		if (!(val & XILINX_PCIE_RPIFR1_INTR_VALID)) {
-			dev_warn(dev, "RP Intr FIFO1 read error\n");
-			goto error;
+			val = irq_find_mapping(port->leg_domain, val);
 		}
 
-		if (val & XILINX_PCIE_RPIFR1_MSI_INTR) {
-			msi_data = pcie_read(port, XILINX_PCIE_REG_RPIFR2) &
-				   XILINX_PCIE_RPIFR2_MSG_DATA;
+		/* Clear interrupt FIFO register 1 */
+		pcie_write(port, XILINX_PCIE_RPIFR1_ALL_MASK,
+			   XILINX_PCIE_REG_RPIFR1);
 
-			/* Clear interrupt FIFO register 1 */
-			pcie_write(port, XILINX_PCIE_RPIFR1_ALL_MASK,
-				   XILINX_PCIE_REG_RPIFR1);
-
-			if (IS_ENABLED(CONFIG_PCI_MSI)) {
-				/* Handle MSI Interrupt */
-				generic_handle_irq(msi_data);
-			}
-		}
+		/* Handle the interrupt */
+		if (IS_ENABLED(CONFIG_PCI_MSI) ||
+		    !(val & XILINX_PCIE_RPIFR1_MSI_INTR))
+			generic_handle_irq(val);
 	}
 
 	if (status & XILINX_PCIE_INTR_SLV_UNSUPP)